40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2270 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  93.06 
 
 
418 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  92.58 
 
 
418 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  845    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  55.74 
 
 
423 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  54.76 
 
 
423 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  54.31 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  53.96 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  53.96 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  54.05 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  51.37 
 
 
434 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  45.81 
 
 
437 aa  266  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42.06 
 
 
424 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  36.72 
 
 
412 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  35.63 
 
 
414 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  35.53 
 
 
409 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  26.98 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  25.68 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  46.67 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  46.67 
 
 
356 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  23.75 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  41.82 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  27.33 
 
 
534 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  44.16 
 
 
533 aa  53.1  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  38.46 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  50 
 
 
344 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  43.48 
 
 
372 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  52.63 
 
 
353 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  47.17 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  51.85 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  43.4 
 
 
659 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  40 
 
 
666 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  45.1 
 
 
595 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  42.86 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2113  hypothetical protein  27.73 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  47.92 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  43.4 
 
 
596 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  39.29 
 
 
626 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  45.24 
 
 
347 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1855  hypothetical protein  43.18 
 
 
382 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0573369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  37.1 
 
 
383 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>