39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6294 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  83.92 
 
 
423 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  98.11 
 
 
423 aa  846    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  83.45 
 
 
423 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  83.69 
 
 
423 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  859    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  83.69 
 
 
423 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  55.74 
 
 
418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  56.67 
 
 
418 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  56.19 
 
 
418 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  43.79 
 
 
434 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  39.04 
 
 
437 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  39.41 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  35.01 
 
 
412 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  35.6 
 
 
414 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  34.86 
 
 
409 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  26.85 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  33.8 
 
 
533 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  27.95 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  48 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  35.38 
 
 
356 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  25.35 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  38.24 
 
 
455 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1518  hypothetical protein  26.83 
 
 
520 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  38.46 
 
 
319 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  40 
 
 
349 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  42.86 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  43.4 
 
 
456 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  25.71 
 
 
356 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  40 
 
 
659 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  36.51 
 
 
440 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  36.54 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  39.13 
 
 
595 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  47.06 
 
 
421 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  37.65 
 
 
483 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  37.74 
 
 
542 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  29.11 
 
 
666 aa  43.5  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  34.62 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>