32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1524 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  839    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  41.12 
 
 		 412 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  39.49 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  39.52 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  34.74 
 
 		 424 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  36.45 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  34.13 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  34.45 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  35.24 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  35.24 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  35.53 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  34.86 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  34.13 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  36.08 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  35.85 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  29.15 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  26.83 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  25.5 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  31.79 
 
 		 533 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  39.53 
 
 		 534 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  36.9 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  30.81 
 
 		 323 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  44.9 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  42.86 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  35.59 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  50 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  47.06 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  28.71 
 
 		 568 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  25.91 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  33.87 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  45.1 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>