36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0645 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  880    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  51.37 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  51.83 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  51.37 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  46.3 
 
 		 423 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  44.24 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  46.3 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  46.3 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  44.95 
 
 		 423 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  43.98 
 
 		 423 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  45.77 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  40.94 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  36.61 
 
 		 414 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  36.45 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  36.34 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  28.81 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  26.55 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  48.21 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  41.43 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  28.86 
 
 		 319 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  24.88 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  48.78 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  46.94 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  31.48 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  41.07 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  51.06 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  42.31 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  32 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  26.11 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  36 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  33.77 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  34.55 
 
 		 666 aa  43.5  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  29.63 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 344 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  35.09 
 
 		 626 aa  43.1  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  39.66 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>