27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2015 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  915    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  51.91 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  31.19 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  25.64 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  26.15 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  26.39 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  25.35 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  26.39 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  25.77 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  25.77 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  26.12 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  25.09 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  28.12 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  23.47 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  28.39 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  27.69 
 
 		 533 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  24.73 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  28.29 
 
 		 298 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  24.83 
 
 		 534 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  47.17 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  28.7 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  29.91 
 
 		 126 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  39.66 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  30.39 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  27.71 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  40.3 
 
 		 356 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>