23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1938 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  100 
 
 		 126 aa  256  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  45.95 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  35.63 
 
 		 666 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  47.17 
 
 		 390 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  35.24 
 
 		 436 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  32.35 
 
 		 455 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  39.73 
 
 		 435 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  29.57 
 
 		 605 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  37.5 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  50 
 
 		 453 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  33.75 
 
 		 483 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  35.71 
 
 		 461 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  27.78 
 
 		 432 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  35.9 
 
 		 456 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  30 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  34.62 
 
 		 464 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  34.67 
 
 		 479 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  32.14 
 
 		 443 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  32.05 
 
 		 356 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  36.96 
 
 		 602 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  37.08 
 
 		 549 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  42.31 
 
 		 429 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>