34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2551 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1068    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  30.73 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  33.16 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  33.16 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  34.56 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  34.69 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  31.77 
 
 
423 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  33.8 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  35.51 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  45.35 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  44.16 
 
 
418 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  36.75 
 
 
409 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  29.94 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  27.61 
 
 
461 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  38.75 
 
 
381 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  59.26 
 
 
437 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  42.86 
 
 
356 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  27.69 
 
 
445 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  49.15 
 
 
323 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  33.87 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  33.87 
 
 
418 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  34.38 
 
 
319 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  43.64 
 
 
298 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  44.26 
 
 
356 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  47.17 
 
 
310 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  37.18 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3014  hypothetical protein  33.93 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  34.62 
 
 
473 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  39.66 
 
 
602 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  28.65 
 
 
422 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  32.84 
 
 
407 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  30.21 
 
 
463 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  41.38 
 
 
625 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  36 
 
 
344 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>