42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3087 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  99.04 
 
 
418 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  92.58 
 
 
418 aa  771    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  56.67 
 
 
423 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  55.24 
 
 
423 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  54.68 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  54.68 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  55.02 
 
 
423 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  55.45 
 
 
423 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  51.37 
 
 
434 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  43.69 
 
 
424 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  46.96 
 
 
437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  35.81 
 
 
412 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  36.45 
 
 
414 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  36.08 
 
 
409 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  27.05 
 
 
445 aa  77  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  27.34 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  48.33 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  27.52 
 
 
534 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  48.15 
 
 
356 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  46 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  35.48 
 
 
533 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  24.23 
 
 
422 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  48.94 
 
 
344 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  52.63 
 
 
353 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  38.89 
 
 
421 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  50.82 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  49.06 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  41.43 
 
 
666 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  42.25 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  44.19 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
596 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  51.28 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  39.29 
 
 
626 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  40.82 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  42.31 
 
 
659 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1855  hypothetical protein  42.86 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0573369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  45.45 
 
 
347 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  37.1 
 
 
383 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  32 
 
 
406 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  27.39 
 
 
417 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2113  hypothetical protein  27.43 
 
 
314 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>