39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0648 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  100 
 
 		 347 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  65.31 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  45.93 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  44.77 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  46.36 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  38.15 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  42.43 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  33.06 
 
 		 356 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  42.09 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  41.77 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  41.77 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  41.77 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  41.77 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  41.77 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  37.01 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  33.52 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  31.07 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  33.86 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  33.13 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  30.74 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  47.27 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  25.76 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  43.33 
 
 		 423 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  43.33 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  43.33 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  43.33 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  45.61 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  26.48 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  43.1 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  27.84 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1146  hypothetical protein  25.11 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  33.76 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  34.62 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  45.45 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  45.45 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  39.13 
 
 		 533 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  29.46 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  32.14 
 
 		 603 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  26.39 
 
 		 568 aa  42.7  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>