40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1882 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  99.42 
 
 
343 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  99.42 
 
 
343 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  99.13 
 
 
343 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  100 
 
 
343 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  99.42 
 
 
343 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  99.42 
 
 
343 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  90.96 
 
 
344 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  58.01 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  57.4 
 
 
346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  55.69 
 
 
346 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  42.43 
 
 
347 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  44.19 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  43.36 
 
 
349 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  37.12 
 
 
356 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  35.87 
 
 
372 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  36.75 
 
 
356 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  29.11 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  38.78 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  48.15 
 
 
418 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  24.73 
 
 
421 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  41.54 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  29.59 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  43.64 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  35.48 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  43.64 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  43.64 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  31.9 
 
 
427 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  38.14 
 
 
424 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  40.79 
 
 
434 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  37.78 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  35.71 
 
 
534 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  37.68 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  38.18 
 
 
423 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  41.03 
 
 
625 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  27 
 
 
461 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  46.03 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  46.51 
 
 
418 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  46.51 
 
 
418 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>