30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3496 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1162    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  25.3 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  26.67 
 
 		 562 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  22.45 
 
 		 500 aa  106  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  22.5 
 
 		 520 aa  94.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  23.68 
 
 		 568 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  19.37 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  22.29 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 		 436 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  21.94 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  24.05 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4623  von Willebrand factor type A  34.16 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  24.56 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  24.15 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  25.1 
 
 		 566 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  22.71 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  24.69 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  21.51 
 
 		 456 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1062  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 357 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  22.9 
 
 		 406 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  19.81 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  27.1 
 
 		 356 aa  46.2  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  26.04 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  19.05 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  28.71 
 
 		 409 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  26.09 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  26.09 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  26.09 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  24.39 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>