31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2049 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  87.57 
 
 
346 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  86.42 
 
 
346 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  56.59 
 
 
344 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  46.36 
 
 
347 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  47.52 
 
 
344 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  54.95 
 
 
343 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  54.95 
 
 
343 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  54.95 
 
 
343 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  54.95 
 
 
343 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  54.95 
 
 
343 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  54.63 
 
 
343 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  39.94 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  36.86 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  34.88 
 
 
372 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  34.13 
 
 
356 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  38.24 
 
 
175 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  33.98 
 
 
381 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  38.96 
 
 
418 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  28 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  40.35 
 
 
434 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  37.07 
 
 
477 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  26.85 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  38.6 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1146  hypothetical protein  25.1 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  32.52 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  25.82 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>