30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3936 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  96.82 
 
 		 346 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  86.42 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  59.64 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  44.77 
 
 		 347 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  57.69 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  57.69 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  57.69 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  57.69 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  57.69 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  57.37 
 
 		 343 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  44.74 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  39.77 
 
 		 349 aa  196  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  38 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  34.79 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  35.84 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  37.04 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  28.01 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  26.63 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  28.04 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  30.16 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  28.8 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  48.08 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  44.23 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  39.62 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  39.62 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  39.62 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  39.62 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1146  hypothetical protein  23.99 
 
 		 383 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>