39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1496 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  879    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  46.99 
 
 		 421 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  30.68 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  28.48 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  47.62 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  47.62 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  45.59 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  31.28 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  46.03 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  46.03 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  46.03 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  46.03 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  30.74 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  45.78 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  30.59 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  49.18 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1146  hypothetical protein  26.79 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  26.79 
 
 		 383 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  27.69 
 
 		 424 aa  53.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  29.49 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  48.08 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  32.82 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  28.79 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  54.35 
 
 		 319 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  61.54 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3014  hypothetical protein  62.16 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  48 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  41.38 
 
 		 666 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0811  hypothetical protein  24.12 
 
 		 183 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  44.44 
 
 		 310 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  39.77 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  51.16 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  50 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  48.39 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1269  von Willebrand factor, type A  24.35 
 
 		 824 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  45.1 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  40.68 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  36.62 
 
 		 534 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  39.71 
 
 		 480 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>