44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5998 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  98.11 
 
 		 423 aa  846    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  84.87 
 
 		 423 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  84.63 
 
 		 423 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  84.87 
 
 		 423 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  85.11 
 
 		 423 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  54.76 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  56.16 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  55.69 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  44.21 
 
 		 434 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  40.09 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  39.91 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  35.01 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  35.63 
 
 		 414 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  34.38 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  28.48 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  29.33 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  34.69 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  46 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1518  hypothetical protein  28.22 
 
 		 520 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  25.8 
 
 		 445 aa  54.3  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  40.38 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  38.24 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  43.48 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  38.1 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  36.51 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  38.89 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  41.54 
 
 		 596 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  31.65 
 
 		 666 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  31 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  32.8 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  40.58 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  35.58 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  38.46 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  36.92 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  27.93 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  40.82 
 
 		 659 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  49.02 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  36.36 
 
 		 310 aa  43.5  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  37.5 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  34.29 
 
 		 473 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>