28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0050 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  792    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  26.5 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  31.25 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  31.15 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  31.06 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  35.79 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  35.58 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1269  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 		 824 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  34.62 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  29.51 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  29.51 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  29.51 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  36.96 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  33.68 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  26.86 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1686  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 826 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000433208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  26.83 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  35.29 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  28.64 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  31.25 
 
 		 353 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  26.85 
 
 		 568 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  34.52 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  24.5 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  23.13 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  41.18 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  27.1 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  28.4 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  40 
 
 		 625 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>