24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2370 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  51.91 
 
 
445 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  32.33 
 
 
422 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  26.91 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  26.85 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  25.8 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  26.79 
 
 
412 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  26.18 
 
 
418 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  25.81 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  27.86 
 
 
298 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  26.8 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  26.8 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  26.8 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  30.83 
 
 
323 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  26.67 
 
 
434 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  26.83 
 
 
414 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  26.83 
 
 
409 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  23.59 
 
 
534 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  27.61 
 
 
533 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  26.91 
 
 
418 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  26.91 
 
 
418 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  35.86 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1518  hypothetical protein  26.28 
 
 
520 aa  43.5  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  30 
 
 
126 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>