37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0795 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  858    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  42.15 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  43.93 
 
 
418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  43.53 
 
 
437 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  43.22 
 
 
418 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  40.49 
 
 
434 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  39.41 
 
 
423 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  39.69 
 
 
423 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  39.69 
 
 
423 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  39.69 
 
 
423 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  39.64 
 
 
423 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  40.32 
 
 
423 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  34.74 
 
 
409 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  36.81 
 
 
414 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  33.72 
 
 
412 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  26.22 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  28.23 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  45.35 
 
 
533 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  32.67 
 
 
356 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  42.86 
 
 
356 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  32.62 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  39.13 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  40.3 
 
 
596 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  27.09 
 
 
534 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  23.81 
 
 
445 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  42.31 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  42 
 
 
659 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  37.5 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  47.37 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  41.38 
 
 
542 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  39.62 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  42.86 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  40 
 
 
651 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  41.86 
 
 
372 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  43.18 
 
 
427 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3014  hypothetical protein  51.28 
 
 
408 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  34.29 
 
 
427 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>