53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0636 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1283    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  47.01 
 
 		 672 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  45.09 
 
 		 678 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  41.92 
 
 		 651 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  35.29 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  35.19 
 
 		 556 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  32.95 
 
 		 603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  27.88 
 
 		 626 aa  111  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  32.13 
 
 		 542 aa  111  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  30.3 
 
 		 604 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  31.17 
 
 		 595 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  29.19 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  28.72 
 
 		 571 aa  77.4  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  30.53 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  30.53 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  30.53 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  30.53 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  30.28 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  30.03 
 
 		 602 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  28.43 
 
 		 608 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  27.89 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  27.89 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  27.67 
 
 		 596 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  26.85 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  28.19 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  28.19 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  29.86 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  29.41 
 
 		 603 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2439  membrane protein-like  35.75 
 
 		 317 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  31.06 
 
 		 542 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  26.21 
 
 		 717 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  25.06 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  28.47 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  28.96 
 
 		 576 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 566 aa  55.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  31.16 
 
 		 621 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  24.04 
 
 		 762 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  29.35 
 
 		 552 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  29.35 
 
 		 552 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  29.7 
 
 		 649 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  28.39 
 
 		 598 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  30.35 
 
 		 575 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  25.25 
 
 		 554 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  40 
 
 		 423 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  43.4 
 
 		 418 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  42.86 
 
 		 423 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  42.86 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  42.86 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  42.86 
 
 		 423 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  27.17 
 
 		 541 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42 
 
 		 424 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  40.82 
 
 		 423 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  27.57 
 
 		 573 aa  43.9  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>