60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2791 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  72.55 
 
 		 596 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1149    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  42.31 
 
 		 602 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  42.31 
 
 		 602 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  42.31 
 
 		 602 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  42.31 
 
 		 602 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  42.31 
 
 		 602 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  42.31 
 
 		 602 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  40.99 
 
 		 602 aa  323  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  42.12 
 
 		 568 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  37.97 
 
 		 626 aa  294  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  37.26 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  37.26 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  37.13 
 
 		 608 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  39.38 
 
 		 598 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  37.8 
 
 		 621 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  36.77 
 
 		 603 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  39.11 
 
 		 649 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  38.94 
 
 		 740 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  38.94 
 
 		 649 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  38.94 
 
 		 597 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  38.94 
 
 		 620 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  38.94 
 
 		 620 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  38.94 
 
 		 620 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  33.71 
 
 		 589 aa  231  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  36.41 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  36.41 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  32.02 
 
 		 648 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  30.08 
 
 		 590 aa  159  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  30.08 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  33.68 
 
 		 563 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  30.27 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  30.72 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  29.24 
 
 		 556 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  28.18 
 
 		 556 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  27.76 
 
 		 571 aa  86.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  28.67 
 
 		 543 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  28.84 
 
 		 603 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  27.84 
 
 		 762 aa  80.9  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  30.41 
 
 		 678 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  31.08 
 
 		 672 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  29.8 
 
 		 659 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  27.45 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  29.91 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  27.42 
 
 		 717 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3250  membrane protein-like  29.64 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2439  membrane protein-like  30.07 
 
 		 317 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  28.37 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  27.62 
 
 		 604 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  39.52 
 
 		 651 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  40.58 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  45.1 
 
 		 418 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0066  hypothetical protein  29.32 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796448 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  39.13 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  40.58 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  40.58 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  37.68 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  40.58 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  33.59 
 
 		 417 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>