40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2274 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  100 
 
 		 666 aa  1375    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  36.31 
 
 		 631 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  36.67 
 
 		 436 aa  101  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  27.22 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  29.13 
 
 		 456 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  28.63 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  27.32 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  31.07 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  26.24 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  27.64 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  27.04 
 
 		 562 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  27.1 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  28.22 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  26.58 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  30.52 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  27.72 
 
 		 566 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  26.28 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  29.71 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  33.04 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  25.7 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  25.93 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  26.74 
 
 		 483 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  35.63 
 
 		 126 aa  53.9  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  27.12 
 
 		 605 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  30.65 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.42 
 
 		 477 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  32.91 
 
 		 423 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  32.91 
 
 		 423 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  32.91 
 
 		 423 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 406 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  28.97 
 
 		 435 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  36.25 
 
 		 582 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  40 
 
 		 418 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  24.64 
 
 		 612 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  31.68 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  31.65 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  27.67 
 
 		 429 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  34.85 
 
 		 356 aa  44.3  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  34.55 
 
 		 434 aa  43.9  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>