20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002646 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  860    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  32.98 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  31.19 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  26.28 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  23.74 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  30.29 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  23.51 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  23.48 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  44.26 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  32.32 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  21.6 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  24.87 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  37.29 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  44.68 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>