38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0869 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  76.31 
 
 		 477 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  972    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  76.11 
 
 		 473 aa  711    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  62.03 
 
 		 478 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  48.6 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  35.76 
 
 		 511 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  30.79 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  29.25 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  29.3 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  28.34 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  30.02 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  27.53 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  27.52 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  28.37 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  28.18 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  26.68 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  27.2 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  27.37 
 
 		 431 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25.88 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  25.3 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  28.83 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  27.93 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  31.58 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  27.84 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  25.65 
 
 		 666 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  32.95 
 
 		 390 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  50 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  29.11 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  30.77 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  42.11 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  27.65 
 
 		 605 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  28.26 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  42.62 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  29.87 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  29.87 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  40.45 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  27.46 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>