39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7530 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1041    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  35.82 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  33.27 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  33.46 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  34.63 
 
 		 482 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  33.65 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  33.65 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  32.49 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  32.17 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  29.55 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  28.98 
 
 		 429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  31.34 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  28.94 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  38.87 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  28.78 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  27.03 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  25.63 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25.48 
 
 		 461 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  28.14 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  24.26 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  26.57 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  32.57 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  32.35 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  34.57 
 
 		 605 aa  70.5  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  31.33 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  47.27 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  28.4 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  29.15 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  32.7 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  31.87 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  26.11 
 
 		 666 aa  52  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  27.43 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  37.29 
 
 		 409 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  25.15 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  27.33 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  26.92 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  38.89 
 
 		 303 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  35.94 
 
 		 359 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>