34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0362 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  899    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  32.97 
 
 
449 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  33.94 
 
 
435 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  33.26 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  31.01 
 
 
429 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  33.33 
 
 
432 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  32.87 
 
 
431 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  33.49 
 
 
432 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  31.13 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  31.95 
 
 
435 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  29.89 
 
 
453 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  31.56 
 
 
443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  27.78 
 
 
461 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.31 
 
 
462 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  30.62 
 
 
468 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  26.99 
 
 
477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  27.95 
 
 
473 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  28.02 
 
 
477 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  27.35 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  25.63 
 
 
511 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  28.87 
 
 
482 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  28.66 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  29.41 
 
 
605 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  29.01 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  28.3 
 
 
464 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  27.5 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  36.11 
 
 
602 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  43.55 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  24.67 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  39.13 
 
 
483 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.9 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  40.35 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  28.66 
 
 
562 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  27.5 
 
 
518 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>