34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2717 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  879    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  54.76 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  51.52 
 
 
435 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  53.29 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  45.37 
 
 
429 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  45.52 
 
 
429 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  47.39 
 
 
443 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  43.76 
 
 
432 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  44.8 
 
 
453 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  43.28 
 
 
449 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  39.35 
 
 
431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  33.26 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  34.04 
 
 
468 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  25.81 
 
 
477 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.73 
 
 
462 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  29.67 
 
 
461 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  25.98 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  26.1 
 
 
473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  27.48 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  26.57 
 
 
511 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  26.07 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  34.13 
 
 
605 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  31.25 
 
 
483 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  30.56 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  29.25 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  30.52 
 
 
456 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  29.68 
 
 
483 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  28.03 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  29.67 
 
 
602 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  30.53 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  28.47 
 
 
440 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  40.38 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  27.81 
 
 
553 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.593229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>