27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2980 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  876    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  41.63 
 
 
449 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  42.4 
 
 
435 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  39.35 
 
 
432 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  39.05 
 
 
429 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  39.91 
 
 
435 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  40.22 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  37.56 
 
 
429 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  41.15 
 
 
443 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  38.89 
 
 
453 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  37.95 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  36.02 
 
 
432 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  33.03 
 
 
437 aa  216  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  26.01 
 
 
511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  29.75 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  29.75 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.37 
 
 
477 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.6 
 
 
461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  25.42 
 
 
482 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  24.68 
 
 
462 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  26.21 
 
 
478 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  27.52 
 
 
568 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  24.2 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  32.78 
 
 
456 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  29.1 
 
 
483 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  25 
 
 
666 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  30.28 
 
 
464 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>