28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0799 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  950    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  39.82 
 
 
431 aa  276  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  34.58 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  33.98 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  31.9 
 
 
429 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  32.91 
 
 
432 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  34.48 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  35.01 
 
 
443 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  32.33 
 
 
429 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  34.04 
 
 
432 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  30.08 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  31.96 
 
 
432 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  30.62 
 
 
437 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  27.6 
 
 
511 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  28.69 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  29.88 
 
 
478 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  27.22 
 
 
482 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  29.23 
 
 
477 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.11 
 
 
461 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  29.03 
 
 
473 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  24.9 
 
 
462 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  41.51 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  40 
 
 
605 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  35.06 
 
 
126 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  41.07 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  26.44 
 
 
518 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  29.17 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  32.99 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>