31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0933 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  99.58 
 
 		 477 aa  963    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  76.24 
 
 		 477 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  964    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  62.37 
 
 		 478 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  50.32 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  33.65 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  30.02 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  29.74 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  29.31 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  27.46 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  28.42 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  31.06 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  28.37 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  26.29 
 
 		 435 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  29.75 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  27.63 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  27.04 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  27.16 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25.91 
 
 		 461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  29.23 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  24.85 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  28.99 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  27.81 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  29.49 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  28.49 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  43.55 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  29.07 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  27.73 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  23.38 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  28.49 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  29.89 
 
 		 549 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>