53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0477 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  901    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  71.75 
 
 		 449 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  66.44 
 
 		 453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  52.63 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  53.06 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  49.54 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  49.08 
 
 		 429 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  48.65 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  46.74 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  43.53 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  41.81 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  36.36 
 
 		 468 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  33.07 
 
 		 511 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  31.33 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  30.21 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  31.06 
 
 		 473 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  30.85 
 
 		 477 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  29.19 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  25.46 
 
 		 462 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25.21 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  28.45 
 
 		 482 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  40 
 
 		 605 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  39.39 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  36.88 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  36 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  34.78 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  33.78 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  33.56 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  54.72 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  29.25 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  33.16 
 
 		 549 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  28.83 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  29.63 
 
 		 520 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  39.34 
 
 		 303 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  27.92 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  25.31 
 
 		 518 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  32.14 
 
 		 126 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  29.07 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  27.04 
 
 		 568 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  27.37 
 
 		 562 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  26.09 
 
 		 612 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  29.75 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  29.75 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  26.09 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  31.28 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  30.86 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  38.33 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  25.47 
 
 		 568 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  42.86 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  31.28 
 
 		 566 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  26.57 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  22.67 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>