32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6382 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  988    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  55.46 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  49.9 
 
 
477 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  48.1 
 
 
477 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  49.9 
 
 
473 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  34.5 
 
 
511 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  29.01 
 
 
435 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  27.99 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  29.23 
 
 
453 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  26.83 
 
 
429 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  27.02 
 
 
449 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  27.47 
 
 
435 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  26.46 
 
 
431 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  25.73 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  29.93 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  28.33 
 
 
443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  27.49 
 
 
468 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  25.83 
 
 
432 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.35 
 
 
462 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  26.29 
 
 
432 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25.62 
 
 
461 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  27.04 
 
 
464 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  41.27 
 
 
455 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  30.43 
 
 
456 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  31.43 
 
 
418 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  36.36 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  36.76 
 
 
483 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  26.04 
 
 
568 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  45.83 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.03 
 
 
666 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  33.33 
 
 
602 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  29.73 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>