55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2418 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  988    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  56.61 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  54.02 
 
 		 455 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  52.55 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  52.36 
 
 		 479 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  59.56 
 
 		 605 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  49.56 
 
 		 602 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  32.41 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  26.06 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  24.33 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  25.67 
 
 		 483 aa  97.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  37.04 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  28.53 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  40.71 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  22.52 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  23.58 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  21.94 
 
 		 568 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.64 
 
 		 666 aa  70.5  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  30.13 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  40.41 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  34.48 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  32.57 
 
 		 511 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  25.07 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  35.16 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  23.09 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  27.78 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  60 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  26.7 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  44.83 
 
 		 453 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  23.06 
 
 		 563 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  29.14 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  24.22 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  23.9 
 
 		 612 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  28.67 
 
 		 409 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  31.96 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  31.33 
 
 		 477 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  46.81 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  25.64 
 
 		 631 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  32 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  31.25 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  26.85 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  29.58 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  39.13 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  32.5 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  33.75 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  33.75 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  38.6 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  33.75 
 
 		 126 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  33.87 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  38.6 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  37.65 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  41.51 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  35.29 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  32.12 
 
 		 407 aa  43.5  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>