42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7591 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  918    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  71.75 
 
 
443 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  61.52 
 
 
453 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  49.67 
 
 
435 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  51.35 
 
 
435 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  45.35 
 
 
429 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  44.9 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  43.18 
 
 
432 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  43.93 
 
 
432 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  43.28 
 
 
432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  41.63 
 
 
431 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  32.97 
 
 
437 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  32.47 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  34.58 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  30.02 
 
 
473 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  30.02 
 
 
477 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  28.42 
 
 
477 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  29.01 
 
 
478 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.71 
 
 
461 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  25.84 
 
 
462 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  27.08 
 
 
482 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  34.48 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  30.41 
 
 
605 aa  63.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  34.81 
 
 
455 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 
436 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  29.82 
 
 
602 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  31.03 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  30.34 
 
 
464 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  32.84 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  26.19 
 
 
518 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  30.06 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  30.86 
 
 
483 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  24.36 
 
 
568 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  26.12 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  39.29 
 
 
303 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  34.48 
 
 
409 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  47.92 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  33.85 
 
 
562 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  28.4 
 
 
549 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  26.04 
 
 
568 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  37.7 
 
 
440 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 
368 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>