24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2922 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2922  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  691    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  39.83 
 
 
353 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  34.28 
 
 
319 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  35.82 
 
 
327 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  33.64 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3425  hypothetical protein  31.68 
 
 
298 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  44.64 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  26.43 
 
 
427 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  37.29 
 
 
423 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  26.34 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  39.22 
 
 
418 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  30.69 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  48.78 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42.59 
 
 
424 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  34.92 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  36.21 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  36.21 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  36.21 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  34.48 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  27.47 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  34.48 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  26.6 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  26.63 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0056  von Willebrand factor type A  23.46 
 
 
847 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.854643  normal  0.269901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>