50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3346 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  100 
 
 
411 aa  844    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  65.45 
 
 
400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  41.08 
 
 
419 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  42.3 
 
 
437 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  25.98 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  24.94 
 
 
456 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  23.94 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  25.06 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  24.43 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  40.51 
 
 
612 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  38.82 
 
 
568 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  38.96 
 
 
553 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  53.66 
 
 
566 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  53.66 
 
 
566 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  42.31 
 
 
582 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  24.43 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  43.08 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  26.84 
 
 
602 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  45.76 
 
 
356 aa  50.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  24.2 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  23.33 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  29.55 
 
 
477 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  31.58 
 
 
126 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  33.94 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  25 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 
406 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  23.4 
 
 
480 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  25.12 
 
 
449 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  37.35 
 
 
434 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  26.99 
 
 
464 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1637  von Willebrand factor (vWF) domain containing protein  27.15 
 
 
794 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  28.92 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  29.59 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  24.09 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  28.15 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0935346 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  30.91 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  32.11 
 
 
520 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  30.91 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  30.85 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  24.72 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  35.53 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  36.07 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  26.19 
 
 
319 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  32.76 
 
 
483 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  23.68 
 
 
518 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  27.71 
 
 
423 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  29.79 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  37.33 
 
 
135 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  36.36 
 
 
418 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>