24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2702 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2702  TadE family protein  100 
 
 		 387 aa  795    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  29.14 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1146  hypothetical protein  28.4 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  26.91 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  32.14 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  29.45 
 
 		 407 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  24.38 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  33.55 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  26.84 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  31.25 
 
 		 427 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  27.32 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4121  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  31.96 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0811  hypothetical protein  32.94 
 
 		 183 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  30.93 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  31.63 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  37.84 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  36.54 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  31.58 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  30.3 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  29.29 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  33.54 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0223  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 396 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.508824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>