49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2602 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  100 
 
 		 500 aa  1024    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  58.67 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  36.07 
 
 		 518 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  32.69 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  33.75 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  29.01 
 
 		 568 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  27.38 
 
 		 605 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  22.03 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  24.17 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  22.2 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  22.03 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  22.52 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  24.01 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  32.6 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  26.15 
 
 		 602 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  25.52 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  24.33 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.98 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  31.65 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0614  hypothetical protein  21.6 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  22.61 
 
 		 563 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  22.54 
 
 		 566 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0904  hypothetical protein  28.23 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  22.78 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  26.63 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  30.85 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  29.73 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0676  hypothetical protein  26.79 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.376647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  25.47 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  28.83 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  34.65 
 
 		 407 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  30.19 
 
 		 631 aa  53.5  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0295  hypothetical protein  22.42 
 
 		 528 aa  53.5  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  27.84 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  27.39 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  24.54 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  32.77 
 
 		 390 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.81 
 
 		 462 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  22.73 
 
 		 553 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  28.48 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  29.53 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  29.53 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4623  von Willebrand factor type A  33.14 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2051  hypothetical protein  23.78 
 
 		 526 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0765678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  35.94 
 
 		 972 aa  43.5  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  25.2 
 
 		 303 aa  43.5  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>