49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2603 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1061    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  58.67 
 
 
500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  33.83 
 
 
518 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  32.22 
 
 
549 aa  217  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  30.41 
 
 
562 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  31.26 
 
 
605 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  30.16 
 
 
436 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  29.44 
 
 
568 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  24.33 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  25 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  25.37 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  22.68 
 
 
456 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  23.32 
 
 
568 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  24.04 
 
 
479 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  26.47 
 
 
602 aa  94.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  28.19 
 
 
605 aa  89  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  24.4 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  35.8 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  29.57 
 
 
420 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  31.02 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  26.28 
 
 
666 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  29.22 
 
 
432 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  28.86 
 
 
435 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0676  hypothetical protein  22.76 
 
 
543 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.376647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  29.65 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  28.86 
 
 
435 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  27.46 
 
 
612 aa  54.3  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  27.32 
 
 
553 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  29.63 
 
 
443 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  28.83 
 
 
473 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  28.83 
 
 
473 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03343  Flp pilus assembly protein TadG  22.15 
 
 
502 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  28.66 
 
 
461 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  27.54 
 
 
449 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0904  hypothetical protein  25.23 
 
 
539 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  29.65 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0614  hypothetical protein  21.65 
 
 
503 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  30.41 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0295  hypothetical protein  26.14 
 
 
528 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  28.38 
 
 
462 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  47  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  31.18 
 
 
566 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  31.18 
 
 
566 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  32.11 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  24.5 
 
 
563 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  38.46 
 
 
582 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  35.59 
 
 
407 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  23.32 
 
 
631 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  43.14 
 
 
390 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>