22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2738 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 419 aa  859    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  39.91 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  40.24 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  39.76 
 
 		 437 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  47.46 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  24.61 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  35.44 
 
 		 612 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  34.09 
 
 		 568 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  41.89 
 
 		 582 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  53.66 
 
 		 566 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  53.66 
 
 		 566 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  26.83 
 
 		 518 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  37.66 
 
 		 135 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  25.56 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  50 
 
 		 576 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  32.98 
 
 		 126 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1637  von Willebrand factor (vWF) domain containing protein  29.36 
 
 		 794 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  41.51 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  37.84 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  28.21 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>