56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1104 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  81.03 
 
 		 406 aa  699    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 420 aa  865    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  73.38 
 
 		 402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  27.62 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  29.57 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  38.41 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  28.41 
 
 		 566 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  26.91 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  28.51 
 
 		 568 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  31.86 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  25.76 
 
 		 605 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  30.73 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  31.46 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  27.55 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  25.1 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  25.46 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  26.6 
 
 		 553 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  28.39 
 
 		 666 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4623  von Willebrand factor type A  35.71 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  31.19 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  27.51 
 
 		 631 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  22.27 
 
 		 568 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  41.38 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  45.76 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  22.06 
 
 		 483 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0614  hypothetical protein  25.59 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  30.08 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  44.44 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  44.44 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  29.32 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  44.44 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  44.44 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  31.95 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  30.61 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  33.74 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  24.72 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1062  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  38.98 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  29.87 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  44.44 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  24.88 
 
 		 602 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  42.59 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  51.28 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  51.28 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  31.85 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  37.74 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  37.74 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  29.13 
 
 		 563 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  21.91 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  30.08 
 
 		 353 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  25.5 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  29.01 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  35.85 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  24.65 
 
 		 303 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>