58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4159 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4159  TadE family protein  100 
 
 		 465 aa  879    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3348  TadE family protein  86.27 
 
 		 569 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.2 
 
 		 2313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.96 
 
 		 830 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  45.67 
 
 		 625 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  40.85 
 
 		 671 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  42.13 
 
 		 605 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  42.52 
 
 		 1394 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  39.66 
 
 		 2353 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  32.4 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  45.95 
 
 		 916 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  49.62 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1679  hypothetical protein  65.45 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.548222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.56 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31.34 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  28.83 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  34.56 
 
 		 153 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  26.83 
 
 		 170 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2314  hypothetical protein  37.93 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  31.69 
 
 		 175 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  42.31 
 
 		 148 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  48.68 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  48.94 
 
 		 157 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  27.16 
 
 		 1000 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  46.94 
 
 		 140 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  45.83 
 
 		 136 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  39.01 
 
 		 653 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  26.62 
 
 		 344 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  38.78 
 
 		 137 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32 
 
 		 633 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  40.51 
 
 		 407 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  47.06 
 
 		 134 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  42.86 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  42.86 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3859  hypothetical protein  47.26 
 
 		 182 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1267  TadE family protein  34.31 
 
 		 175 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  52.46 
 
 		 1281 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  44 
 
 		 168 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  34.67 
 
 		 167 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  44.86 
 
 		 1159 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.27 
 
 		 930 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  45.45 
 
 		 192 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  41.07 
 
 		 164 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  50.98 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3711  peptidase-like  41.18 
 
 		 232 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  45.71 
 
 		 772 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  53.06 
 
 		 1137 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0111  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1165 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  46.58 
 
 		 682 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  52 
 
 		 914 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  65.22 
 
 		 771 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  29.2 
 
 		 144 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1977 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  32.52 
 
 		 136 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  51.39 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  33.33 
 
 		 952 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4532  hypothetical protein  23.97 
 
 		 416 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0112828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>