108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1838 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  100 
 
 
132 aa  269  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  39.47 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  41.22 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  57.63 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  33.63 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32.41 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  36.09 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  33.33 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  37.17 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  38.58 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.79 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  60 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  38.14 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  35.71 
 
 
126 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  32.82 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  29.55 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  44.62 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  52.08 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  42.86 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  42.86 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  41.67 
 
 
153 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  48.15 
 
 
168 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  34.55 
 
 
140 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  43.64 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  44.64 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  41.67 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  46.94 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  44.64 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  44.64 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  26.19 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  36.9 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  48.94 
 
 
167 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  42.62 
 
 
149 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  51.06 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  44.9 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  38.6 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  38.6 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  38.6 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  46.94 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  52.17 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  27.4 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  45.1 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  36.84 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  44.07 
 
 
180 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  27.19 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  44.44 
 
 
722 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  42.59 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  39.62 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  36.84 
 
 
147 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44.68 
 
 
155 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  42.59 
 
 
177 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  40.74 
 
 
177 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  40.74 
 
 
177 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  40.74 
 
 
177 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4122  TadE family protein  44.26 
 
 
144 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44.68 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44.68 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44.68 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44.68 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44.68 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44.68 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  31.45 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  45.45 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  40.74 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  29.33 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  37.74 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  44.74 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  30.28 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  41.51 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  42.37 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  32.43 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  57.45 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  28.78 
 
 
175 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  26.02 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  44 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  58 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  44.44 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  30.22 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  30.22 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  30.22 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  30.22 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1409  TadE family protein  30.43 
 
 
217 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.659631  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  35.17 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  40 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  40 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  32.14 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  44.68 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  40 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  29.71 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  37.5 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  40.82 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  29.71 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4120  TadE family protein  37.25 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  34.4 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  31.67 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2314  hypothetical protein  40.32 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1037  TadE family protein  38.52 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>