12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3200 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  100 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  87.35 
 
 		 166 aa  278  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4622  TadE family protein  41.98 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.482057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  35.9 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  34.72 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  37.04 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  28.95 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  46.67 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  31.9 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  40.35 
 
 		 143 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  41.3 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  31.96 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>