34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0801 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0801  TadE family protein  100 
 
 		 141 aa  289  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  39.22 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  40.15 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  46.3 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  46.3 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  34.34 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  48.08 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  49.06 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  36.36 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  31.67 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  51.72 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  36.17 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  36.84 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  29.6 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  43.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  43.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  43.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  43.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  36.84 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  42.19 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  31.54 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  42.19 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  31.11 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  30.56 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  40.38 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  39.34 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  39.34 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  33.33 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  25.44 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  44.9 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  34.92 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>