More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5492 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5505  thiamine pyrophosphate protein  80.44 
 
 		 606 aa  957    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0784  thiamine pyrophosphate protein  80.2 
 
 		 608 aa  1003    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3203  thiamine pyrophosphate protein  58.21 
 
 		 590 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1999  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  63.62 
 
 		 593 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0409327  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4440  thiamine pyrophosphate protein  65.66 
 
 		 608 aa  790    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0772  thiamine pyrophosphate protein  80.03 
 
 		 608 aa  999    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0548988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2032  thiamine pyrophosphate protein  78.59 
 
 		 613 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977535  hitchhiker  0.00000144173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0946  thiamine pyrophosphate protein  80.03 
 
 		 744 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0076  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  75.04 
 
 		 596 aa  917    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.686266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0471  thiamine pyrophosphate protein  65.89 
 
 		 601 aa  825    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2732  thiamine pyrophosphate protein  75.84 
 
 		 596 aa  949    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6385  thiamine pyrophosphate protein  78.49 
 
 		 610 aa  996    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1467  thiamine pyrophosphate protein  65.48 
 
 		 588 aa  826    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0017  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  56.06 
 
 		 599 aa  694    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0808  thiamine pyrophosphate protein  64.25 
 
 		 593 aa  793    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2495  thiamine pyrophosphate protein  57.17 
 
 		 599 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215575  normal  0.718329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0068  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  74.71 
 
 		 596 aa  919    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.736165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6147  thiamine pyrophosphate protein  80.94 
 
 		 612 aa  966    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0509796  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1836  thiamine pyrophosphate protein  77.67 
 
 		 613 aa  957    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208772  normal  0.385639 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1284  thiamine pyrophosphate protein  80.57 
 
 		 635 aa  990    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283585  normal  0.383394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0287  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  63.47 
 
 		 597 aa  790    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4190  thiamine pyrophosphate protein  63.59 
 
 		 615 aa  798    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0856  thiamine pyrophosphate protein  63.24 
 
 		 593 aa  785    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.701267  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6220  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  71.19 
 
 		 596 aa  865    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863586  normal  0.0472829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1291  thiamine pyrophosphate protein  81.11 
 
 		 611 aa  964    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2718  thiamine pyrophosphate protein  62.12 
 
 		 594 aa  728    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08480  thiamine pyrophosphate protein  75.08 
 
 		 598 aa  895    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00807055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0414  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  73.95 
 
 		 597 aa  872    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2979  thiamine pyrophosphate protein  75.34 
 
 		 595 aa  950    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0396438 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6569  thiamine pyrophosphate protein  80.94 
 
 		 608 aa  961    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37340  thiamine pyrophosphate protein  57.7 
 
 		 590 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000027158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0860  thiamine pyrophosphate protein  63.24 
 
 		 593 aa  783    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33590  thiamine pyrophosphate protein  53.94 
 
 		 596 aa  672    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6540  thiamine pyrophosphate protein  81.11 
 
 		 611 aa  964    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.230604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2089  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  73.37 
 
 		 597 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4175  thiamine pyrophosphate protein  56.14 
 
 		 593 aa  675    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296619  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5492  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 597 aa  1224    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.165409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2966  thiamine pyrophosphate protein  75.34 
 
 		 595 aa  931    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2436  thiamine pyrophosphate protein  75 
 
 		 595 aa  947    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262777  normal  0.635484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3966  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  57.82 
 
 		 597 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3686  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  55.37 
 
 		 599 aa  675    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0906801  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4857  thiamine pyrophosphate protein  55.95 
 
 		 603 aa  685    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2355  thiamine pyrophosphate protein  73.66 
 
 		 598 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320889  hitchhiker  0.000848806 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6283  thiamine pyrophosphate protein  80.91 
 
 		 608 aa  958    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.368758  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2796  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  53.83 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0268922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  54.77 
 
 		 596 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3238  thiamine pyrophosphate protein central region  53.36 
 
 		 614 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1982  thiamine pyrophosphate protein  51.72 
 
 		 596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200304  normal  0.0807898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3376  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  52.63 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4340  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  47.58 
 
 		 574 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0579862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4426  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.58 
 
 		 574 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247244  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4720  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.58 
 
 		 574 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2122  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  40.74 
 
 		 584 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6370  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  42.34 
 
 		 599 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.529318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2151  pyruvate oxidase  43.6 
 
 		 584 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4042  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.3 
 
 		 605 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5572  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  39.97 
 
 		 600 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2495  pyruvate oxidase  35.75 
 
 		 566 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2426  pyruvate oxidase  35.58 
 
 		 566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0695657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2360  pyruvate oxidase  35.06 
 
 		 566 aa  357  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  35.23 
 
 		 566 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  35.06 
 
 		 566 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1818  pyruvate oxidase  31.87 
 
 		 578 aa  310  5e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0736  pyruvate dehydrogenase [cytochrome]  35.19 
 
 		 563 aa  304  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  31.73 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  31.73 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02710  pyruvate dehydrogenase (cytochrome)  35.53 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1052  pyruvate dehydrogenase  34.13 
 
 		 572 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0935  pyruvate dehydrogenase  34.13 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1033  pyruvate dehydrogenase  33.96 
 
 		 572 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1002  pyruvate dehydrogenase  33.96 
 
 		 572 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0970  pyruvate dehydrogenase  33.96 
 
 		 572 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2115  pyruvate oxidase  30.3 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.100527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1531  pyruvate dehydrogenase  33.95 
 
 		 576 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.885242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2314  pyruvate dehydrogenase  34.67 
 
 		 601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.493557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2374  pyruvate dehydrogenase  35.08 
 
 		 573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0972  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.67 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1032  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 572 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0900  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 572 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2460  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 572 aa  283  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0975  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 572 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3125  pyruvate dehydrogenase  34.09 
 
 		 574 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.765369  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2771  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.45 
 
 		 572 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2510  pyruvate dehydrogenase  34.28 
 
 		 572 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2725  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 572 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00876  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 572 aa  283  9e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.688216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00882  hypothetical protein  33.45 
 
 		 572 aa  283  9e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.731415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0944  pyruvate dehydrogenase  33.45 
 
 		 572 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0203  pyruvate dehydrogenase  33.89 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0234842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0635028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2788  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.08 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.987771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3149  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.27 
 
 		 572 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1387  pyruvate dehydrogenase  33.61 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5205  pyruvate dehydrogenase  34.24 
 
 		 573 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0024  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.5 
 
 		 578 aa  273  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.338176  normal  0.262087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2294  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 578 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5095  pyruvate dehydrogenase  33.62 
 
 		 573 aa  273  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2427  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.88 
 
 		 574 aa  273  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0700684  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3312  pyruvate dehydrogenase  33.56 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653262  normal  0.0298964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>