130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3397 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  59.22 
 
 		 581 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  100 
 
 		 581 aa  1199    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  58.18 
 
 		 558 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  57.8 
 
 		 581 aa  675    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  50.09 
 
 		 602 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  48.27 
 
 		 550 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  48.08 
 
 		 563 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  45.33 
 
 		 583 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  44.29 
 
 		 588 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  44.74 
 
 		 604 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  39.32 
 
 		 602 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  35.56 
 
 		 593 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  35.99 
 
 		 606 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  35.99 
 
 		 606 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  35.69 
 
 		 557 aa  317  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  36.56 
 
 		 611 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  33.82 
 
 		 565 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  33.58 
 
 		 564 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  33.94 
 
 		 552 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  30.66 
 
 		 556 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  32.57 
 
 		 581 aa  280  7e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  33.05 
 
 		 585 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  33.46 
 
 		 521 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  33.39 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  32.6 
 
 		 535 aa  259  8e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  32.75 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  32.56 
 
 		 534 aa  257  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  32.82 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  31.57 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  31.4 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  27.11 
 
 		 590 aa  242  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  27.11 
 
 		 590 aa  242  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  27.11 
 
 		 590 aa  242  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  29.6 
 
 		 561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  29.39 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  29.6 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  31.86 
 
 		 849 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  29.66 
 
 		 571 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  27.85 
 
 		 577 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  27.73 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.62 
 
 		 581 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  29.21 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  29.07 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  28.55 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  30.21 
 
 		 529 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  28.92 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  29.06 
 
 		 553 aa  216  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  27.81 
 
 		 543 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.75 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28 
 
 		 590 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28 
 
 		 562 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  28.94 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  26.98 
 
 		 591 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  28.08 
 
 		 574 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  27.97 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  29.91 
 
 		 563 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  29.91 
 
 		 563 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  27.29 
 
 		 579 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  31.7 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  27.99 
 
 		 565 aa  204  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  27.48 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  27.48 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  28.02 
 
 		 528 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  26.88 
 
 		 562 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  26.88 
 
 		 562 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  26.66 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  28.55 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  26.53 
 
 		 569 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  28.69 
 
 		 491 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  31.54 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  27.67 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  28.35 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  27.15 
 
 		 537 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  26.6 
 
 		 537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  25.87 
 
 		 580 aa  173  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  57.52 
 
 		 163 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.78 
 
 		 535 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  28.57 
 
 		 510 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.73 
 
 		 535 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  27.49 
 
 		 542 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  26.39 
 
 		 584 aa  151  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.68 
 
 		 542 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  27.13 
 
 		 556 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  26.64 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  28.22 
 
 		 540 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.83 
 
 		 540 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26 
 
 		 545 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.74 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  23.69 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.36 
 
 		 629 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  23.58 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  23.58 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  22.44 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.24 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  22.06 
 
 		 555 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  21.05 
 
 		 555 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  29.36 
 
 		 229 aa  98.6  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  30.39 
 
 		 215 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  21.39 
 
 		 551 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  26.69 
 
 		 504 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>