More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1605 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  76.83 
 
 
250 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  75.2 
 
 
250 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  63.79 
 
 
250 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  63.79 
 
 
250 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  63.79 
 
 
250 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  63.37 
 
 
249 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  63.11 
 
 
249 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  62.55 
 
 
250 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.04 
 
 
250 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  58.89 
 
 
266 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  56.63 
 
 
266 aa  277  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  56.57 
 
 
262 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  63.11 
 
 
746 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  56.22 
 
 
257 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  63.11 
 
 
758 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  55.69 
 
 
249 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  56.28 
 
 
259 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.11 
 
 
752 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  62.7 
 
 
761 aa  274  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.7 
 
 
755 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  62.7 
 
 
746 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  55.69 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  62.7 
 
 
749 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  62.7 
 
 
741 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  55.28 
 
 
249 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  56.79 
 
 
253 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  57.55 
 
 
253 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  53.47 
 
 
264 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  51.59 
 
 
269 aa  255  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  56.38 
 
 
249 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  56.2 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  55.56 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  51.65 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  51.65 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  50.99 
 
 
266 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
250 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.68 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  50.6 
 
 
258 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  50.2 
 
 
275 aa  242  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  47.62 
 
 
259 aa  242  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  51.64 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  48.77 
 
 
258 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  48.97 
 
 
251 aa  211  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  48.95 
 
 
250 aa  208  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  48.35 
 
 
272 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  45.87 
 
 
250 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  44.21 
 
 
254 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  46.37 
 
 
252 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  45.93 
 
 
256 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  47.26 
 
 
251 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  44.22 
 
 
252 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  47.74 
 
 
251 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  46.69 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  45.49 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  45.35 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  45.08 
 
 
250 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.07 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44.58 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  43.9 
 
 
256 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  43.9 
 
 
256 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  46.75 
 
 
248 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  44.21 
 
 
250 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.64 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  47.56 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.17 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  46.06 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  46.22 
 
 
252 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.13 
 
 
252 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  45.42 
 
 
251 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  42.34 
 
 
255 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  41.77 
 
 
253 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  42.91 
 
 
258 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
249 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
271 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  41.2 
 
 
256 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  41.91 
 
 
261 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  41.2 
 
 
257 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  45.15 
 
 
250 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  41.91 
 
 
840 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  40.8 
 
 
256 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  45.87 
 
 
246 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  41.2 
 
 
268 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
255 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  45.31 
 
 
270 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  45.45 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  41.08 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  43.09 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.56 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 
277 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  49.16 
 
 
255 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  45.31 
 
 
270 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  41.6 
 
 
278 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  42 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  46.61 
 
 
250 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44.4 
 
 
250 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  47.23 
 
 
250 aa  188  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  41.08 
 
 
257 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.17 
 
 
246 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>