More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1599 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  100 
 
 
267 aa  547  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  89.77 
 
 
266 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  90.8 
 
 
278 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  90.42 
 
 
288 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  89.39 
 
 
266 aa  483  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  89.39 
 
 
266 aa  483  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.39 
 
 
266 aa  483  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.39 
 
 
266 aa  483  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.39 
 
 
266 aa  483  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.39 
 
 
266 aa  483  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  89.39 
 
 
266 aa  483  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  67.06 
 
 
265 aa  361  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  59.68 
 
 
280 aa  332  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  60.08 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.45 
 
 
259 aa  326  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  59.84 
 
 
259 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  57.95 
 
 
266 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  59.84 
 
 
262 aa  324  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  59.54 
 
 
282 aa  322  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  60.16 
 
 
260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  59.45 
 
 
262 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  59.29 
 
 
301 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  54.41 
 
 
266 aa  304  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  53.05 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  55.91 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  58.89 
 
 
305 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  55.91 
 
 
316 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  51.35 
 
 
267 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  52.33 
 
 
266 aa  292  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  55.12 
 
 
255 aa  288  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  55.73 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  55.6 
 
 
282 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  55.79 
 
 
294 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
289 aa  274  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  54.37 
 
 
269 aa  271  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
258 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  53.12 
 
 
274 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  51.91 
 
 
274 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  51.78 
 
 
271 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  50.57 
 
 
274 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  51.33 
 
 
267 aa  250  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.45 
 
 
249 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  45.68 
 
 
273 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  43.32 
 
 
271 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  46.5 
 
 
247 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  43.37 
 
 
244 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.49 
 
 
273 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  43.58 
 
 
261 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.8 
 
 
258 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.51 
 
 
257 aa  205  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  40.39 
 
 
260 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.62 
 
 
259 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.77 
 
 
268 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  40.96 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  40.24 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  43.6 
 
 
277 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.24 
 
 
273 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.65 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.03 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  40.49 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  41.53 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  40.71 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  40 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  46.26 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  41.49 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  42.13 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.94 
 
 
254 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  41.74 
 
 
261 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.26 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 
258 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  41.87 
 
 
264 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.04 
 
 
524 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.04 
 
 
524 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.68 
 
 
524 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  40.94 
 
 
262 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
527 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.04 
 
 
524 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.56 
 
 
260 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  38.46 
 
 
513 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  38.68 
 
 
524 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  38.8 
 
 
518 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  43.36 
 
 
245 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.68 
 
 
524 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  42.37 
 
 
243 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  37.45 
 
 
513 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.66 
 
 
499 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  42.39 
 
 
276 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  39.92 
 
 
284 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  40.49 
 
 
260 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  39.77 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  40.4 
 
 
519 aa  188  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  38.37 
 
 
513 aa  188  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  42.51 
 
 
260 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.63 
 
 
503 aa  188  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  44.34 
 
 
256 aa  188  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  38.76 
 
 
251 aa  188  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  36.36 
 
 
265 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>