More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2115 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  100 
 
 
353 aa  696    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  59.52 
 
 
343 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  54.12 
 
 
340 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.19 
 
 
352 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
391 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
344 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
362 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
371 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.64 
 
 
371 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.78 
 
 
355 aa  189  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
344 aa  189  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
344 aa  189  9e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
365 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.09 
 
 
365 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  33.52 
 
 
367 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
352 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.82 
 
 
356 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.76 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.22 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
365 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.03 
 
 
373 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  32.36 
 
 
348 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  33.05 
 
 
352 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.92 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
352 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
360 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.03 
 
 
350 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
365 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.33 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
352 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
352 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.64 
 
 
372 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  32.86 
 
 
352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  32.86 
 
 
352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
352 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.31 
 
 
338 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.82 
 
 
353 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  30.85 
 
 
347 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
354 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  26.72 
 
 
373 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
354 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
442 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  33.93 
 
 
370 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.43 
 
 
349 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
365 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.07 
 
 
347 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  28.62 
 
 
364 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  27.99 
 
 
451 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  30.21 
 
 
365 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  29.28 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
363 aa  139  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  31.34 
 
 
388 aa  139  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  30 
 
 
351 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
349 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
349 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  27.98 
 
 
358 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6252  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7968 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  28.32 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  28.32 
 
 
403 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.64 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  30.28 
 
 
437 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  25.58 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  32.41 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  29.5 
 
 
427 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  29.08 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.7 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  25.73 
 
 
400 aa  129  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  25.29 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  31.05 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  24.92 
 
 
368 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  30.58 
 
 
365 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  28.76 
 
 
417 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 
383 aa  126  5e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
454 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  30.15 
 
 
364 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  27.25 
 
 
334 aa  126  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  27.08 
 
 
462 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.47 
 
 
471 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  30.24 
 
 
414 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  29.86 
 
 
361 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  30.26 
 
 
349 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  26.35 
 
 
349 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  26.67 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  27.86 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.2 
 
 
463 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  26.43 
 
 
375 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  26.71 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  29.59 
 
 
409 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  30.53 
 
 
360 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  30.11 
 
 
361 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  27.91 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  28.97 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.76 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  30.43 
 
 
408 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  27.14 
 
 
528 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  28.42 
 
 
441 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>