More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1695 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
295 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
295 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
295 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
295 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
295 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
295 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
295 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  61.49 
 
 
334 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  54.61 
 
 
320 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  54.61 
 
 
320 aa  309  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  54.27 
 
 
314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  48.17 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
339 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 
306 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
300 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 
298 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 
300 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
327 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
305 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
314 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
291 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
325 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
297 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  28.73 
 
 
316 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
304 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 
316 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
315 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
305 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
321 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
303 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
303 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2588  transcriptional regulator, LysR family protein  27.34 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 
363 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
324 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 
343 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  22.18 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1434  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1834  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
310 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  22.57 
 
 
294 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
311 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1355  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 
284 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
296 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  26.36 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2387  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0274334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2246  transcriptional regulator, LysR family  33.74 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2622  transcriptional regulator, LysR family  32.05 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.342108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2022  LysR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3312  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.86 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.404557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>